BI project

Gene Expression Profiling of Colon Cancer Metastatic Cells by RNA-sequencing

Проект посвящён основной проблеме современной онкологии метастазированию. Целью проекта являлся сравнительный анализ транскриптомов четырёх линий клеток рака прямой кишки с различной способностью к метастазированию. В рамках проекта был проведён анализ данных РНК секвенирования с использованием двух различных подходов: c использованием последовательности референсного генома и сборка de novo без использования референса.

MGRA [2,3,..].0

MGRA (Multiple Genome Rearrangements and Ancestors) - это инструмент, позволяющий восстанавливать геномы предков и историю геномных перестроек по нескольким входным геномам.

Reference-assisted assembly using colored breakpoint graphs

В рамках летней стажировки "Reference-assisted assembly using colored breakpoint graphs" (июнь - июль 2013) была проведена работа над одной из задач по разработке инструмента Ragout.

IG Container

Работа выполнена в рамках летней стажировки 2013. 

Pages

Subscribe to RSS - BI project