Analysis of Rearrangements in the Bordetella Bronchiseptica Genomes
Проект посвящен анализу геномных перестроек у бактерий Bordetella Bronchiseptica. Для трех референсных геномов и шестидесяти одной сборки были найдены блоки синтении и построен breakpoint граф. Структура графа позволила обнаружить высокую склонность данных бактерий к перестройкам, что также подтвердилось при попарном выравнивании геномов. Кроме того, при анализе графа в геномах были обнаружены "хрупкие" места, в которых перестройки происходили особенно часто.
Время выполнения проекта:
Jul 2014 — Aug 2014