Поиск корреляции между метилированием и социальным статусом в геноме человека

Работа посвящена поиску корреляции между профилями метилирования CpG-мотивов в геномах детей и их социально-экономическим статусом. В качестве материала для исследования выступают метиломы российских сирот, усыновленных в США (контрольная группа представляет из себя российских детей, имеющих биологических родителей; метиломы получены методом MBD-Seq).

В ходе исследования разработан пайплайн, позволяющий оценить различия в профилях метилирования до и после усыновления, выявить гены, на экспрессию которых эти различия влияют, и кластеризовать найденные гены по их функции. На тестовых образцах были обнаружены изменения в метилировании ряда генов, в частности, ответственных за развитие организма. Планируется применять разработанный пайплайн в дальнейших исследованиях и провести биологическую интерпретацию данных, полученных на расширенном датасете.

Студент:
   Кирилл Григорьев
Время выполнения проекта: Feb 2014 — May 2014
Файлы:
   grigorev_final_31052014.pdf