Изучение распределения ДНК древних людей в современных геномах

Для изучения распределения ДНК древних людей в современных геномах были поставлены и выполнены следующие задачи:

• провести первичную обработку полногеномных данных
• изучить и выбрать наиболее адекватные меры расстояний между геномами
• исследовать распределение "древних генов" в геномах современных людей различных популяций (HapMap, 1000Genomes)

По итогам работы предложен новый, альтернативный для PCA, метод нахождения частоты встречаемости генотипа древних людей в генотипах современных людей, получены навыки в обработке данных из проекта 1000 Genomes, преобразовании SNPs по ререфенсу в форму представления 0, 1, 2.