Strategies for the Development of Panels of Genetic Markers for Human Identification

Проект посвящен стратегиям разработки панелей генетических маркеров для идентификации личности. В криминалистике и судебной медицине используются тесты идентификации личности, основанные на генетическом материале. Основным идентификатором является аллель. Для каждого аллеля характерна своя частота в конкретной популяции, что позволяет решать задачи о выборе наиболее эффективных маркеров для заданного набора популяций. Основными генетическими маркерами являются SNP и STR, которые, благодаря короткой длине маркера, позволяют работать даже с сильно деградированной ДНК.

В ходе данного проекта было необходимо разработать панель генетических маркеров для заданного набора популяций, позволяющую установить личность человека с заданным уровнем достоверности. Была спроектирована база данных по аллельным частотам генетических вариантов в различных популяциях на основе баз данных ALFRED и STRBase. Были написаны скрипты для развертывания базы данных, импорта, фильтрации и анализа данных. Был спроектирован, реализован и оптимизирован алгоритм составления списка генетических маркеров с оценкой их эффективности для составления панели. Также были предложены и реализованы первые версии алгоритмов решения проблемы сцепленности маркеров. Предложенные методики были обоснованы и доказаны теоретически, а наши экспериментальные результаты коррелируют с показателями уже существующих панелей.