Mini-metagenomes Assembled by SPAdes

Работа посвящена обработке мини-метагеномов, собранных с помощью SPAdes. Рассмотрены методы разделения контигов по видам (metagenome binning) без использования баз данных бактериальных геномов. Рассмотрены различные методы построения векторов для кластеризации, а также различные методы кластеризации. Данные брались как смоделированные, так и реальные.

Время выполнения проекта: Jul 2014 — Aug 2014
Файлы:
   akseshina_13092014.pdf