Mini-metagenomes Assembled by SPAdes
Работа посвящена обработке мини-метагеномов, собранных с помощью SPAdes. Рассмотрены методы разделения контигов по видам (metagenome binning) без использования баз данных бактериальных геномов. Рассмотрены различные методы построения векторов для кластеризации, а также различные методы кластеризации. Данные брались как смоделированные, так и реальные.
Время выполнения проекта:
Jul 2014 — Aug 2014