Сборка модели центромерного района хищников

Несмотря на большое количество прочитанных геномов млекопитающих, практически все они содержат пробел длинной в три миллиона пар оснований на каждой хромосоме, зарезервированный на несобранный на настоящий момент центромерный район. Центромера является важным компонентом генома и принимает участие в сборке кинетохора, в соединении сёстринских хроматид и конъюгации гомологичных хромосом. Кроме того, для последовательностей находящихся в центромерном районе показана транскрипция и особое эпигенетическое маркирование. Центромера млекопитающих сформирована главным сложно устроенными полями тандемных повторов, которые принято называть сателлитной ДНК. В статье, которая была взята за основу проекта, авторы предлагают метод, которым можно реконструировать приблизительную модель центромерного района, без сборки линейной последовательности, но содержащую информацию о количественном содержание различных фрагментов и их взаимоположение в центромерном районе. Целью проекта было повторить данную статью используя центромерные фрагменты человека, и сделать всё то же самое для домашней кошки.