Сборка аминокислотных подпоследовательностей

Сборка аминокислотных подпоследовательностей из масс-спектров антител очень важна для изучения их свойств и антигенной специфичности. Основная идея алгоритма заключается в поиске тегов – небольших аминокислотных подпоследовательностей и их дальнейшее продление при помощи выравнивания спектров. Основным результатом является восстановления более 50% вариабельного региона на основе top-down данных. Также были получены небольшие аминокислотные подпоследовательности при использовании bottom-up данных.

Студент:
   Виталий Демьянюк
Куратор:
   Кира Вяткина
Время выполнения проекта: Sep 2013 — Dec 2013