Сборка аминокислотных подпоследовательностей
Сборка аминокислотных подпоследовательностей из масс-спектров антител очень важна для изучения их свойств и антигенной специфичности. Основная идея алгоритма заключается в поиске тегов – небольших аминокислотных подпоследовательностей и их дальнейшее продление при помощи выравнивания спектров. Основным результатом является восстановления более 50% вариабельного региона на основе top-down данных. Также были получены небольшие аминокислотные подпоследовательности при использовании bottom-up данных.
Время выполнения проекта:
Sep 2013 — Dec 2013