Анализ ошибок в чтениях, полученных в результате секвенирования технологий Ion Torrent

Для ридов, получаемых с помощью Ion Torrent, характерны ошибки вставки-удаления (инделы). Чтение идет по гомополимерам, и информация о длине приходит в виде сигнала, из-за чего она определяется неточно. Чем длиннее гомополимеры, тем хуже распознается их длина. Такие ошибки приводят к сдвигам в выравнивании.
В работе рассмотрено использование скрытых марковских моделей для имитации процесса чтения строк из гомополимеров. Реализованы алгоритмы для оценки параметров такой модели.