Удивительная синхрония в эволюции нуклеарных и митохондриальных геномов

В среду, 21 декабря, в 19:00 Михаил Садовский, Институт вычислительного моделирования СО РАН, выступит в Институте биоинформатики с открытой лекцией на тему: «Удивительная синхрония в эволюции нуклеарных и митохондриальных геномов».

Современная биоинформатика пошла по «жадному» пути: исследователи пытаются отыскать множество конкретных и специфических фактов из жизни генов и геномов, слишком часто пренебрегая общими ограничениями и неоправданно игнорируя необходимость доказательства наиболее общих утверждений. В частности, это приводит к тому, что такая сравнительно хорошо проработанная область биоинформатики, как изучение частотных словарей, всё равно страдает от недостатка теорем и теоремоподобных утверждений, накладывающих принципиальные ограничения на те эффекты, которые можно на них наблюдать.

Напротив, мы стараемся получить так много знания о символьных последовательностях, соответствующих геномам (либо иным генетическим «единичкам»), как можно, без привлечения дополнительного, внешнего знания о свойствах этих самих последовательностей.

Пример такого подхода и некоторые результаты будут представлены на лекции. Если совсем кратко, то мы рассмотрим корреляции между кластерами, в которые «сбиваются» геномы митохондрий исключительно на основе знаний о частотах триплетов (sic!) и филогенией их носителей. Эта корреляция (и очень сильная) и доказывает факт «удивительной синхронии»: близкие по структуре геномы оказываются близкими и по филогении. Всё бы ничего, да только близость структур определялась по геномам митохондрий, а филогенетическая — по морфологии...

Для кого

Лекция рассчитана на любого заинтересованного и активного слушателя. Хорошо бы знать, что такое метод динамических ядер (K-means зовётся он в тёплых краях), но если об этом есть самые поверхностные сведения, то и ничего страшного — разберёмся. Знакомство с упругими картами приветствуется, но вовсе необязательно.

О лекторе

Родился в Ленинграде (конкретно — в Пулково, не в аэропорту), живет в Красноярске. Работает ведущим научным сотрудником в Институте вычислительного моделирования СО РАН. В определённых кругах гораздо более известен как многолетний организатор Красноярской летней школы.

Рабочий язык — русский. Участие бесплатное. Необходима предварительная регистрация. 

Место проведения: Санкт-Петербург, ул. Кантемировская, д. 2, БЦ "Таймс", 2 этаж.