Алгоритмы в биоинформатике для биологов
Курс: Алгоритмы в биоинформатике.
Преподаватель: Федор Царев.
Даты: Mar 2014 — May 2014.
Программа курса:
- Алгоритмы поиска кратчайших путей в графах.
- Алгоритмы поиска минимальных остовных деревьев.
- Вычислительная сложность. Классы сложности P и NP. NP-трудные и NP-полные задачи.
- Приближенные и эвристические алгоритмы.
- Машинное обучение. Типы задач, решаемых в машинном обучении.
- Задача регрессии. Линейная регрессия. Оверфиттинг. Регуляризация.
- Задача классификации. Логистическая регрессия. Метод k соседей.
- Байесовский классификатор.
- Деревья решений. Random forest.
- Кластеризация. Метод k средних.
- Иерархическая кластеризация.
- Методы выбора признаков (feature selection).
- Численные методы. Метод Монте-Карло. Метод спуска.
- Линейное программирование. Целочисленное линейное программирование.
По итогам курса предусмотрен экзамен.