Алгоритмы в биоинформатике для биологов

Курс: Алгоритмы в биоинформатике.

Преподаватель: Федор Царев.

Даты: Mar 2014 — May 2014.


Программа курса:

  1. Алгоритмы поиска кратчайших путей в графах.
  2. Алгоритмы поиска минимальных остовных деревьев.
  3. Вычислительная сложность. Классы сложности P и NP. NP-трудные и NP-полные задачи.
  4. Приближенные и эвристические алгоритмы.
  5. Машинное обучение. Типы задач, решаемых в машинном обучении.
  6. Задача регрессии. Линейная регрессия. Оверфиттинг. Регуляризация.
  7. Задача классификации. Логистическая регрессия. Метод k соседей.
  8. Байесовский классификатор.
  9. Деревья решений. Random forest.
  10. Кластеризация. Метод k средних.
  11. Иерархическая кластеризация.
  12. Методы выбора признаков (feature selection).
  13. Численные методы. Метод Монте-Карло. Метод спуска.
  14. Линейное программирование. Целочисленное линейное программирование.

По итогам курса предусмотрен экзамен


Материалы курса