Павел Яковлев
С 2012 года учится в магистратуре СПбАУ РАН по направлению "Биоинформатика". С октября 2012 года сотрудничает с компанией Биокад, с сентября 2013 возглавляет в ней группу биоинформатики. Решает задачи аннотирования белков функциональными характеристиками, а также математической обработки результатов экспериментов. Научные интересы: иммунология, протеомика, алгоритмы.
Организация: BIOCAD
Преподаваемые курсы:
| Название курса | Начало | Окончание | Преподаватель |
|---|---|---|---|
| Структурная биология, осень 2014 | 19 Sep 2014 | 5 Dec 2014 | Павел Яковлев |
Руководитель проектов:
| Название проекта | Начало | Окончание | Студент | Руководитель |
|---|---|---|---|---|
| Анализ поверхности взаимодействия белков и поиск наиболее значительных позиций методом in silico Ala-scan | Jul 2014 | Jun 2015 | Татьяна Малыгина | Павел Яковлев |
| Название проекта | Начало | Окончание | Студент | Руководитель |
|---|---|---|---|---|
| Моделирование конформационных изменений структур вариабельных доменов антител | Sep 2014 | Jun 2015 | Тимофей Бондарев | Павел Яковлев |
| Предсказание оксидирования метионина с использованием информации о третичной структуре белка | Sep 2014 | Jun 2015 | Игорь Гайдай | Павел Яковлев |
| Название проекта | Начало | Окончание | Студент | Руководитель |
|---|---|---|---|---|
| Screening Pipeline Construction Application | Sep 2014 | Dec 2014 | Никита Карташов | Павел Яковлев |
| Поиск иммуногенных фрагментов на белковых последовательностях | Sep 2014 | Dec 2014 |
Дарья Сергеева Максим Купрашевич Павел Чуприков |
Павел Яковлев |
| Название проекта | Начало | Окончание | Студент | Руководитель |
|---|---|---|---|---|
| Автоматизация подготовки гомологического фолдинга | Jul 2014 | Aug 2014 | Тимофей Бондарев | Павел Яковлев |
| Название проекта | Начало | Окончание | Студент | Руководитель |
|---|---|---|---|---|
| Immunoglobulin folding | Feb 2014 | May 2014 | Маргарита Аксёшина | Павел Яковлев |
| Название проекта | Начало | Окончание | Студент | Руководитель |
|---|---|---|---|---|
| Иерархическая кластеризация данных NGS | Sep 2013 | Dec 2013 |
Ирина Смолина Олег Яснев |
Александр Карабельский Павел Яковлев |
| Нахождение регионов в вариабельных доменах иммуноглобулинов | Sep 2013 | Dec 2013 | Константин Федоров |
Александр Карабельский Павел Яковлев |
| Обработка данных секвенирования Sanger | Sep 2013 | Dec 2013 |
Дмитрий Мелешко Татьяна Малыгина |
Александр Карабельский Павел Яковлев |