E-value в BLAST (материалы)
Две лекции Антона Коробейникова на Летней школе по биоинформатике 2013 были посвящены теме "E-value в BLAST". Слайдов на лекции представлено не было, но ниже можно ознакомиться со списоком рекомендованных материалов по результатам лекции*:
Книги:
Ewens, W.J and Grant, G. R. Statistical Methods in Bioinformatics. Springer, 2005.
Isaev, A. Introduction to Mathematical Methods in Bioinformatics. Springer, 2004.
Статьи:
Samuel Karlin and Altschul, S.F. Methods for assessing the statistical significance of molecular sequence features by using general scoring schemes. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 87(1990):2264-2268
Samuel Karlin, Amir Dembo, and Tsutomu Kawabata. Statistical Composition of High-Scoring Segments from Molecular Sequences. Ann. Statist. Volume 18, Number 2 (1990), 571-581.
Amir Dembo, Samuel Karlin, and Ofer Zeitouni. Limit Distribution of Maximal Non-Aligned Two-Sequence Segmental Score. Ann. Probab. Volume 22, Number 4 (1994), 2022-2039.
Amir Dembo, Samuel Karlin, and Ofer Zeitouni. Critical Phenomena for Sequence Matching with Scoring. Ann. Probab. Volume 22, Number 4 (1994), 1993-2021.
* Обращаем внимание, что для понимания данных изданий требуется достаточно серьезное знание математики (например, на уровне профильных специальностей математико-механических факультетов).