E-value в BLAST (материалы)

Две лекции Антона Коробейникова на Летней школе по биоинформатике 2013 были посвящены теме "E-value в BLAST". Слайдов на лекции представлено не было, но ниже можно ознакомиться со списоком рекомендованных материалов по результатам лекции*:

Книги:

Ewens, W.J and Grant, G. R. Statistical Methods in Bioinformatics. Springer, 2005.

Isaev, A. Introduction to Mathematical Methods in Bioinformatics. Springer, 2004.

Статьи:

Samuel Karlin and Altschul, S.F.  Methods for assessing the statistical significance of molecular sequence features by using general scoring schemes. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 87(1990):2264-2268

Samuel Karlin, Amir Dembo, and Tsutomu Kawabata. Statistical Composition of High-Scoring Segments from Molecular Sequences.  Ann. Statist. Volume 18, Number 2 (1990), 571-581.

Amir Dembo, Samuel Karlin, and Ofer Zeitouni. Limit Distribution of Maximal Non-Aligned Two-Sequence Segmental Score. Ann. Probab. Volume 22, Number 4 (1994), 2022-2039.

Amir Dembo, Samuel Karlin, and Ofer Zeitouni. Critical Phenomena for Sequence Matching with Scoring.  Ann. Probab. Volume 22, Number 4 (1994), 1993-2021. 


* Обращаем внимание, что для понимания данных изданий требуется достаточно серьезное знание математики (например, на уровне профильных специальностей математико-механических факультетов).