Cеминар по системной биологии 2017

Санкт-Петербург, 14-19 мая

Прием заявок окончен | Список участников

Четвертый год подряд Институт биоинформатики и Университет ИТМО проводят семинар по системной биологии с участием приглашенных лекторов из Washington University in St. Louis и Harvard University. По традиции семинар пройдет за городом, что позволит всем участникам максимальное количество времени посвятить занятиям и общению.

Семинар фокусируется на переходе от биоинформатики к экспериментальной биологии, отдельно останавливаясь на биологических основах омиксных данных и соответствующих экспериментальных подходах для сбора данных и проверки гипотез. Мы рассмотрим подходы к генерации полногеномных данных от экспрессии генов, РНК-, ChIP-, и экзомного секвенирования, до высокоэффективной метаболомики и интеграции данных при помощи сетевых методов.

Каждый день семинара будет состоять из нескольких теоретических лекций в сопровождении практических модулей, в которых участники смогут пройти полный путь по биоинформатической обработке и анализу полно-геномных экспериментов, а также обсудить биологические следствия полученных результатов. 

Формат

Пять дней интенсивных занятий с перерывами на еду и прогулки пройдут в загородном клубе «Дача». Теоретические занятия будут сопровождаться практическими, на которых участники смогут самостоятельно выполнить простые вычисления и обсудить биологические выводы.

Фотографии с прошлых семинаров: 2014, 2015, 2016. 

Рабочими языками семинара являются русский и английский (слайды).

Программа

• Введение в секвенирование. РНК-секвенирование и анализ экспрессии генов. 
• Медицинская и популяционная генетика. 
• Транскрипционная и эпигенетическая регуляция. 
• Метаболическая регуляция и введение в метаболомику.

Подробное расписание.

Спикеры

	Максим Артемов (PhD) Washington University in St. Louis
	Александр Предеус (PhD) Bioinformatics Institute, St Petersburg
	Никита Артемов (PhD) Harvard University, Massachusetts General Hospital, Broad Institute
	Алексей Сергушичев, к.т.н. ITMO University, JetBrains Research, Washington University in St. Louis
	Герман Демидов Center for Genomic Regulation, Barcelona

Каждая тема включает практические занятия, в проведении которых будут участвовать Екатерина Эсаулова и Константин Зайцев.

Подробная информация о спикерах.

Участники 

Мы приглашаем участников из академических заведений и из коммерческих компаний - всех, кто хочет узнать о подходах, используемых в математической и системной биологии, и их применениях. Необходимо базовое знание биологии, а также работы в командной строке Linux (рекомендуем пройти бесплатный онлайн-курс «Введение в Linux» тем, кто не уверен в своих знаниях). 

Отбор на семинар проводится на конкурсной основе. 

Организационные взносы

Участие в семинаре платное. Взнос покрывает проживание, трансфер, питание и сопутствующие материалы.

• За подачу заявки до 12 февраля предоставляется скидка 10% от стоимости участия при успешном прохождении конкурсного отбора. 
• Лучшим академическим заявкам будут предоставлены гранты от организаторов. 
• Скидка 30% для студентов и выпускников Института биоинформатики. 

Договор-оферта

Партнерские предложения

Мы будем рады новым партнёрам и предложениям о сотрудничестве!