Улучшение бининга контигов в метагеномных сборках с использованием графа сборки

Цель проекта - разработка и реализация стратегии улучшения бининга контигов в метагеномных сборках с использованием графа сборки.

В ходе проекта был реализован пайплайн для обработки контигов, использующий сборщик SPAdes и существующий алгоритм кластеризации контигов. На основе предварительной кластеризации выполняется дополнение бинов путём обхода графа сборки, полученного с помощью SPAdes.

Результатом работы является улучшенная аннотация полученных с помощью SPAdes контигов, представленая файлом с парами contig_id : bin_id. Работа тестировалась только на искусственных метагеномах.