Анализ корреляции между биохимическими свойствами ампликонов и эффективностью амплификации в мультиплексной ПЦР

Полимеразная цепная реакция повсеместно используется в молекулярной биологии и связана с большим количеством практических областей (диагностика инфекционных заболеваний, криминалистка, секвенирование и пр.).
Особенностью протоколов ПЦР для подготовки образца к секвенированию является высокая степень мультиплексности (большое количество ампликонов синтезируются в одной пробирке параллельно). Качество мультиплексной реакции определяется равномерностью покрытия таргетных регионов и устойчивостью к минорным изменениям условий реакции, зависящим от свойств праймеров и ампликонов. 

Задачей данного проекта было выделить свойства праймеров и ампликонов, влияющие на количество ампликонов в результате проведения ПЦР, определить степень связи между этими параметрами и результатом. В итоге был получен набор значимых признаков для оценки качества подбираемых праймеров и, в дальнейшем, работы ПЦР.