Идентификация генов семейства nxf в новых геномах
Гены семейства nxf (nuclear export factor) обнаружены у грибов и животных. У различных организмов в состав этого семейства входит разное число генов: от одного до пяти. Ген nxf1, давший название семейству, является наиболее древним и консервативным в семействе. У этого гена кроме основного транскрипта существует альтернативная форма с невырезаемым интроном.
Основными задачами данной работы являлись аннотация генов семейства в недавно секвенированных геномах и проверка "сомнительных" аннотаций. Была предпринята попытка провести аннотацию гена nxf1 у семейства Drosophilidae и класса Nematoda с помощью программ Splign и ProSplign.
Время выполнения проекта:
Sep 2014 — Dec 2014