Поиск ретротранспозонов в больших последовательностях

В геноме эукариот очень много мобильных элементов. Считается, что они оказывают значительное влияние на эволюцию гена и структуры хромосом. Существуют значительная потребность в идентификации подобных мобильных элементов. Полные ретровирусные последовательности составляют существенную часть генома позвоночных. В данной работе были разобраны основные методы поиска мобильных элементов, а так же рассмотрены популярные программы, реализующие эти методы, их достоинства и недостатки.