Mammalian Ragout

Проект посвящен усовершенствованию утилиты Ragout. Ragout (Reference-Assisted Genome Ordering UTility) - это программный продукт, позволяющий улучшать сборку, основываясь на информации о геномах родственных организмов. Изначально проект разрабатывался для бактериальных геномов, но было решено расширитa алгоритм для возможности работы с более длинными геномами млекопитающих. Однако были обнаружены ошибки при сборке генома дрозофилы. В течение летней стажировки было предложено собрать данный организм и изучить работу Ragout на нем. По собранным данным были исправлены overlap графы, используемые Ragout для сборки дрозофилы.