Search for Correlation of Socioeconomic Status and Methylation Profiles

С целью установить, существует ли зависимость профиля метилирования от факта усыновления, был проведен сравнительный анализ метиломов российских сирот, усыновленных резидентами США, соответственно, до и после усыновления (временной промежуток 6 месяцев).

В ходе исследования разработан пайплайн, позволяющий оценить различия в профилях метилирования до и после усыновления, выявить гены, на экспрессию которых эти различия влияют, и кластеризовать найденные гены по их функции. На тестовых образцах были обнаружены изменения в метилировании ряда генов, в частности, ответственных за развитие организма. 

Пайплайн, помимо сторонних приложений, включает в себя также пакет Loki, разработанный авторами исследования.

Планируется применять пайплайн в дальнейших исследованиях и провести биологическую интерпретацию данных, полученных на расширенном наборе данных.