Virtual target screening for KY0211 inhibitor

Компьютерное моделирование взаимодействия белок-лиганд представляет собой аналог биологического скрининга и позволяет определять наиболее вероятные мишени для исследуемого вещества. Лиганды, связывающиеся с активными центрами ферментов и модулирующие тем самым сигнальные каскады, являются потенциальными фармакологическими препаратами, способными привести в норму аномальное изменение активности сигнального пути.

Целью проекта являлась идентификация мишени ингибитора сигнального пути WNT (KY02111) с помощью методов виртуального скрининга. Виртуальный скрининг проводился с помощью программного обеспечения LeadIT (модуль FlexX) и HEX8. Исходной выборкой служили белки сигнального пути WNT и результаты предсказания активности ингибитора KY02111 системой PASS online.

В результате были определены наиболее вероятные мишени KY0211 (с наименьшими значениями оценочной функции): beta-TrCP (β-tranducin repeats containing protein), STAT3 (signal transducer and activator of transcription 3) и CYP2C8 (Cytochrome P450).