Misassemblies detection without reference

Проект посвящен оценке качества сборки генома. На сегодняшний день продукт QUAST может обнаружить ошибки в контигах (misassemblies) только при наличии референсной последовательности. Однако, такая последовательность доступна далеко не для всех организмов. Задачей проекта стало выявление ошибок сборки при отсутствии референса. В ходе работы была написана утилита, принимающая на вход сборку генома и набор парных ридов, и формирующая отчет о возможных ошибках в сборке.

Студент:
   Анна Лиознова
Куратор:
   Алексей Гуревич
Время выполнения проекта: Feb 2014 — May 2014
Файлы:
   lioznova_final_31052014.pdf