Misassemblies detection without reference
Проект посвящен оценке качества сборки генома. На сегодняшний день продукт QUAST может обнаружить ошибки в контигах (misassemblies) только при наличии референсной последовательности. Однако, такая последовательность доступна далеко не для всех организмов. Задачей проекта стало выявление ошибок сборки при отсутствии референса. В ходе работы была написана утилита, принимающая на вход сборку генома и набор парных ридов, и формирующая отчет о возможных ошибках в сборке.
Время выполнения проекта:
Feb 2014 — May 2014