Приложение для клинической интерпретации онкоэкзома человека

Цель – за три месяца создать программу, которая сможет приносить пользу реальным людям.  Это приложение должно будет уметь анализировать экзом человека, больного раком, и помогать врачу принять правильное решение о том, какая терапия может быть эффективной.

Основные задачи биолога:

1. разработка алгоритмов аннотирования и фильтрации найденых мутаций;
2. создание и курирование баз данных с информацией о мутациях, имеющих клиническое значение, и таргетных препаратах и их мишенях;
3. тестирование приложения на данных, полученных на различных платформах.

Основные задачи информатика:

1. написание скриптов для аннотирования/фильтрации мутаций;
2. написание скриптов для визуализации данных с использованием, например, библиотеки D3.js;
3. написание скриптов для генерации pdf-отчетов, содержащих наиболее важную для врача информацию;
4. интеграция приложения в одну из существующих биоинформационных платформ.