Сравнительный анализ данных по РНК-секвенированию раковых клеток с использованием платформы Trinity

Проект посвящён одной из основных проблем современной онкологии - метастазированию. Целью проекта является широкомасштабная оценка транскриптома метастатических клеток рака прямой кишки методом РНК-секвенирования. В рамках проекта был проведён анализ данных РНК секвенирования с помощью сборки транскриптома de novo, без использования референса. В результате анализа были получены профили дифференциальной экспрессии для четырёх клеточных линий, отличающихся уровнями экспрессии онкомаркеров. Проведена аннотация транскриптов, на основе которой составлен перечень белок-кодирующих генов, предположительно ассоциированных с метастазированием.