Polymorphism Analysis in Diploid Genomes

Сборка диплоидных геномов - это сложная и на данный момент не до конца решенная задача из-за наличия различий между гапломами. DipSPAdes - приложение, предназначенное для сборки диплоидных геномов, использующее графы де Брюина. Целью данного проекта являлся анализ работы dipSPAdes на различных данных, поиск сложных полиморфизмов и модификация существующего алгоритма построения консенсусных контигов для корректной работы с такими полиморфизмами.

Время выполнения проекта: Feb 2014 — May 2014