Связь последовательностей с отклонениями в частотах аминокислот с белок-белковыми взаимодействиями

Известно большое количество белков, имеющих участки, обогащенные определенными аминокислотами и взаимодействующие друг с другом. Данная работа посвящена исследованию роли обогащенных определенными аминокислотами участков в белок-белковых взаимодействиях и того, для каких белков характерен такой механизм взаимодействия. Целью проекта являлось изучение зависимости количества взаимодействий у белка с другими белками и наличия у обоих участников взаимодействия подпоследовательностей с измененной частотой одинаковых аминокислот в протеомах ряда эукариот. Мы изучили связь взаимодействий между белками с наличием участков, обогащенных определёнными аминокислотами, при помощи ресэмплинга и выявили ряд белков, для которых такая связь может быть значимой. Мы определили, для каких функциональных групп белков связь количества взаимодействий между белками с наличием участков, обогащенных определёнными аминокислотами, проявляется сильнее всего при помощи аннотации с использованием Gene Ontology и обнаружили обогащение в для мембранных белков.

Время выполнения проекта: Feb 2014 — May 2014