Нахождение регионов в вариабельных доменах иммуноглобулинов

Проект посвящен разработке ПО для поиска генов и поиска регионов в вариабельных доменах иммуноглобулинов, и является логическим продолжением проекта летней практики. Был разработан масштабируемый сервер, объединяющий в себе несколько способов поиска регионов и генов, включая способы, основанные на машинном обучении, и способы, основанные на аппаратном ускорении алгоритма локального выравнивания (на CPU и GPU). Сервер позволяет объединять различные этапы обработки данных (такие как поиск регионов, кластеризация и т.п.) в единый конвейер для удобной работы с результатами секвенирования.

Время выполнения проекта: Sep 2013 — Dec 2013
Файлы:
   fedorov.pdf