Изучение структурных вариаций в геноме Mycobacterium tuberculosis

Целью проекта является поиск структурных вариаций генома различных штаммов Mycobacterium tuberculosis (обычно изучаются лишь однонуклеотидные полиморфизмы). Для этого необходимо провести сборку геномов M. tuberculosis до контигов, их сравнение с референсными геномами (прежде всего, H37Rv) с использованием биоинформатических подходов, определить вероятные области геномных перестроек и методом ПЦР проверить наличие указанных перестроек в образцах ДНК отобранных изолятов. Это исследование позволит лучше изучить структуру генома M. tuberculosis, а также, возможно, обнаружить потенциальные генетические маркеры определенных штаммов, выявить новые механизмы патогенеза этой бактерии и выработки ею лекарственной устойчивости.