Оценка качества секвенирования

Решалась задача фильтрации ридов. В результате проекта был написан быстрый тул фильтрации адаптеров и праймеров на основе алгоритма Ахо-Корасик, а также разработан и верифицирован алгоритм разделения контаминированных алгоритмов на основе анализа коротких k-меров. Данный алгоритм существенно улучшает определение контаминант и разделение ридов по сравнению с использованием GC - контента.