Разработка R-пакета для деконволюции типов клеток по данным экспрессии
ClusDec - это программа, осуществляющая деконволюцию типов клеток по данным экспрессии. Целью проекта было протестировать ClusDec на разных данных и валидировать результаты его работы. В результате предложен вариант, как осуществлять аннотацию клеточных типов по маркерный генам, так как стандартные программы (DAVID, MSigDB) не позволяют отличить близкие типы клеток, а также оценены некоторые метрики, использующиеся при деконволюции.
Время выполнения проекта:
Sep 2015 — Dec 2015