Студенты, аспиранты и соискатели

В лаборатории системной биологии МФТИ и протеомики ИБХ РАН приглашаются студенты, а также соискатели для выполнения курсовых/дипломных/диссертационных работ и участия в грантах. Предлагаемые работы могут быть выполнены на базе МФТИ, ИБХ РАН и НИИ ФХМ.

Работы связаны с биоинформатическим анализом данных, полученных на современных масс-спектрометрах и секвенаторах. Направления: системная биология, сравнение протеомных, метаболомных, транскриптомных и геномных данных.
 

Темы:

1. “Выявление функциональных связей между потенциальными пептидными биомаркерами социально-значимых заболеваний человека, идентифицированными в сыворотке крови”
2. Особый интерес для нашей лаборатории представляют онкологические, аутоиммунные и нейродегенеративные заболевания.
3. “Исследование механизмов межклеточной коммуникации при раке яичников на основе изучения протеома и транскриптома асцитической жидкости”
4. “Поиск специфических протеаз, принимающих участие в образовании потенциальных пептидных маркеров социально-значимых заболеваний человека”
5. “Анализ пост-трансляционных модификаций белков и пептидов в сыворотке крови и установление их роли в развитии патологического процесса в организме человека”
6. “Изучение экзома человека для выявления мутаций, связанных с орфанными заболеваниями”
7. “Исследование популяционно-специфичных мутаций экзома человека”
8. “Поиск пептидов, кодируемых короткими рамками считывания (sORF), основываясь на данных транскриптома и пептидома модельного организма мха Physcomitrella patens”
9. “Протеогеномная ре-аннотация генов мха Physcomitrella patens”
10. “Анализ геномной вариабельности, сравнительная и функциональная геномика бактерий по данным полногеномного секвенирования”
11. Объекты исследования: N.gonorrhoeae, M.tuberculosis, S.aureus, S.pneumonia, E.coli
12. “Поиск генетических маркеров лекарственной устойчивости патогенных бактерий, на основе данных полногеномного секвенирования”

Требования к кандидату:

• Интерес к освоению новых программных продуктов и расчетным методам анализа данных,
• отличные навыки работы за ПК,
• умение программировать.

Что предлагаем:

• Поступление в аспирантуру РАН или МФТИ.
• В случае активного участия в работе лаборатории – достойная материальная поддержка.

Контакты

Георгий Арапиди, +7 926 471 14 20, arapidi@gmail.com