Лаборатория алгоритмической биологии, СПбАУ РАН

Лаборатория алгоритмической биологии создана на базе Санкт-Петербургского Академического университета РАН под руководством профессоров Павла Певзнера и Максима Алексеева и при поддержке Министерства образования и науки РФ (Постановление 220, «мегагрант»).

Лаборатория решает важнейшие алгоритмические и вычислительные задачи геномики и протеомики, находящиеся на острие биоинформатики и являющиеся источниками горячих научных споров. Лаборатория сотрудничает с ведущими экспертами в биоинформатике из США и России.

Лаборатория работает над следующими проектами:

• Новый подход к секвенированию и сборке геномов. Лаборатория разрабатывает геномный ассемблер SPAdes, который может точно собирать геномы как бактерий, выводимых в изоляции, так и некультивируемых бактерий по данным из одной клетки. Это немаловажно для исследования микробиома человека и разработки новых антибиотиков.
• Новый подход к идентификации и секвенированию белков, антител и антибиотиков.