Мета-анализ экспрессии генов в жировой ткани человека

Жировая ткань- это разновидность соединительной ткани, состоящая из жировых клеток адипоцитов. В дополнение к адипоцитам, она содержит стромальную сосудистую фракцию клеток, включающую в себя преадипоциты, фибробласты, сосудистые эндотелиальные клетки и макрофаги жировой ткани. Жировая ткань образуется из преадипоцитов. Адипозная ткань является самым большим эндокринным органом в организме человека, активно секретирующим гормоны и сигнальные молекулы. Ее гипертрофированное развитие у человека ведёт к ожирению, что может вызвать развитие воспаления, резистентности к инсулину и нарушение секреторной активности. Поэтому многие широко распространенные заболевания (сахарный диабет 2-го типа, хронические воспалительные процессы, метаболический синдром) связанны с изменениями в функциях жировой ткани. В ходе выполнения работы был проведен анализ изменений экспрессии генов в адипозных тканях человека, возникающих в результате варьирования биологических условий (клеточная дифференцировка, голодание, обработка активными веществами), на основе публично доступных данных.

ДНК-микрочип – технология, широко применяемая для анализа экспрессии генов. Для анализа была собрана и проаннотирована база данных экспериментов на основе ДНК-микрочипов, по измерению экспрессии генов в адипоцитарной ткани человека. Данные были разбиты на группы (биопсия, мРНК, обработка медикаментами) и сведены в единые датасеты для мета-анализа каждой группы. Был произведен анализ сигнальных путей и динамик экспрессии генов в группах.