Поиск консервативных аминокислотных остатков для белка альфа-кристаллина позвоночных
Альфа-кристаллины - это АТФ-независимые молекулярные шапероны, они экспрессируются в высоких концентрациях в хрусталике глаза позвоночных, где играют основную роль в поддержании прозрачности хрусталика. Кроме того, было показано, что кристаллины способны связывать металлы, проявлять различные ферментативные активности и не редко являются ключевым звеном в развитии нейродегеративных заболеваний. Несмотря на биологическую важность данного белка, его полная структура остается загадкой. Для решения это проблемы методами биоинформатки требудется детальный анализ белковых последовательностей альфа-кристаллинов.
В ходе работы было проведено исследование всех известных на данный момент аминокислотных последовательностей альфа-кристаллинов: поиск консервативных остатков, выявление профиля структурированности полипептидных цепей, предсказание амилоидогенных участков и анализ аминокислотного состава альфа-кристаллинов.