Интенсив по геномной биоинформатике
Осенью-весной 2017/2018 интесивы проводиться не будут
Трехдневный интенсив построен по модульной системе: в каждой части последовательно рассматриваются отдельные стадии ведения геномного проекта. Бóльшую часть курса занимают практические занятия.
По итогам участники получают не только общие представления о методах работы с геномными данными (как бактериальными, так и человеческими), но и проиходят все важнейшие методы работы на практике. На интенсиве также можно получить консультацию по своим научным проектам. Рабочий язык — русский.
Программа
- Секвенирование, базы данных
- Работа на удаленных серверах
- Контроль качества
- Сборка геномов
- Аннотация геномов, поиск генов
- Выравнивание последовательностей, поиск полиморфизмов
- Обзор областей геномной биоинформатики
Программа интенсива тесно связана с онлайн-курсом «Введение в биоинформатику», подготовленного совместно СПбГУ c Институтом биоинформатики.
Программы: первого, второго, третьего и четвертого интенсивов. Ниже можно посмотреть вводную лекцию с первого интенсива, прошедшего в апреле 2015 года:
Лекторы
Занятия проведут ведущие научные сотрудники биоинформатических лабораторий Санкт-Петербурга и Москвы. В прошлых семинарах участвовали:
- Алла Лапидус, Центр алгоритмической биотехнологии СПбГУ
- Алексей Гуревич, Центр алгоритмической биотехнологии СПбГУ
- Андрей Пржибельский, Центр алгоритмической биотехнологии СПбГУ
- Александр Предеус, Институт биоинформатики
- Антон Брагин, Parseq Lab
- Вадим Назаров, ИБХ РАН, НИУ ВШЭ
- Павел Добрынин, Центр геномной биоинформатики СПбГУ