Статистика, весна 2012

Курс: Статистика.

Преподаватель: Антон Коробейников.

Даты: Feb 2012 — May 2012.

I. Теория

1 Основы.
1.1 Вероятность, среднее, дисперсия, основные теоремы и определения из теории вероятностей.
1.2 Основные распределения, нормальное распределение, распределения, связанные с нормальным.
1.3 Понятие выборки и эмпирического распределения.
1.4 Оценивание параметров. Метод моментов. Метод максимального правдоподобия. Доверительные интервалы.
 
2 Проверка статистических гипотез.
2.1 Простейшие примеры (t-критерий и рядом).
2.2 Непараметрические методы (критерий Вилкоксона и пр.)
2.3 Критерии согласия: Колмогорова-Смирнова, Андерсона-Дарлинга, хи-квадрат и пр.
 
3 Линейные модели.
3.1 Определение. Линейная регрессия. Построение доверительных интервалов для оценок параметров модели и регрессии. Выбор наилучшей модели (информационные критерии типа Акайке).
3.2 ANCOVA.
3.3 Сравнение в группах. One-way, two-way ANOVA.
 
4 Обобщенные линейные модели.
 
II Практика
1. Статистические основы анализа microarray data.
2. P-value / E-value в BLAST
3. NGS / Quake
 
Литература
Wim P. Krijnen (2009). Applied Statistics for Bioinformatics using R
Warren J. Ewens and Gregory Grant (2005) Statistical Methods in Bioinformatics. An Introduction.
Julian J. Faraway (2002) Practical Regression and ANOVA using R

 

# Лекции и файлы Дата и время
1 Лекция 1 18 Feb 2012 - 13:00 to 14:45
2 Лекция 2 3 Mar 2012 - 11:00 to 12:30
3 Лекция 3 3 Mar 2012 - 13:00 to 14:45
4 Лекция 4 17 Mar 2012 - 11:00 to 12:45
5 Лекция 5 17 Mar 2012 - 13:00 to 14:45
6 Лекция 6 24 Mar 2012 - 13:00 to 14:45
7 Лекция 7 31 Mar 2012 - 12:00 to 13:45
8 Лекция 8

Binary Data demo.r 		7 Apr 2012 - 12:00 to 13:45
9 Лекция 9 21 Apr 2012 - 10:00 to 11:30
10 Лекция 10 21 Apr 2012 - 12:00 to 13:45
11 Лекция 11 28 Apr 2012 - 12:00 to 13:45
12 Лекция 12 12 May 2012 - 12:00 to 13:45
13 Лекция 13 19 May 2012 - 12:00 to 13:45
14 Лекция 14

Plain text icon cancer.txt, Plain text icon galileo.txt, Plain text icon insectsprays.txt, Plain text icon mlbattend.txt, Plain text icon pi2000.txt, Plain text icon pulp.txt, Plain text icon toothgrowth.txt 		26 May 2012 - 12:00 to 13:45