Практические навыки биоинформатического анализа последовательностей

Курс: Анализ данных.

Преподаватель: Александр Предеус.

Даты: Apr 2016 — May 2016.


Подавляющее большинство практических задач, встающих перед современными биоинформатиками, так или иначе связаны с анализом результатов секвенирования. Александр Предеус расскажет основные стратегии, применяемые в реальной жизни для реальных задач: оценить, насколько хорошо получаются эксперименты в вашей лаборатории, правильно ли настроен секвенатор, и как понять, что пошло не так. 

В качестве практической задачи заинтересованные студенты будут разбиты на 4 группы и им будет предложено 4 файла, о которых неизвестно ничего - кроме того, что они будут содержать одинаковое количество коротких прочтений в формате fastq. Используя все подходящие инструменты, группам нужно будет собрать максимальное количество информации об их последовательностях, и сделать практические выводы.