Applications in Genome BioInformatics, серия семинаров
Курс: Биоинформатика.
Преподаватель: Алла Лапидус.
Даты: Sep 2013 — Dec 2013.
Курс представляет собой открытые семинары лаборатории геномной биоинформатики им. Ф.Г.Добржанского, которые проходят по адресу Санкт-Петербург, Средний пр. В.О., д. 41А. За всеми обновлениями и изменениями в расписании следите на сайте лаборатории.
Course structure:
11.09.2013 (Wed)
Introduction to BioInformatics (Dr. A. Lapidus)
Введение в биоинформатику
18.09.2013 (Wed)
NGS and Bioinformatics applications (Dr. A. Lapidus)
Новые технологии сиквенса ДНК и биоинформатика
23.09.2013 – Lab (Monday)
Wet lab sequencing demo (if MiSeq works - Dr.E.Chernyaeva, P. Dobrynin, Dr.A.Lapidus)
24.09.2013 (Tue)
The promise of Comparative genomics – postGenome 10K and beyond (Dr. S. O’brien- in English)
02.10. 2013 (Wed)
Human genome project historical and practical perspectives (Dr. O. Bajenova)
Проект геном человека
07.10. 2013 (Monday)
Mining cancer genomes using bioinformatics approaches (Dr. O.Bajenova)
Роль биоинформатики в изучении генетики рака
09.10. 2013 (Wed)
Computers and programs are sine qua non to bioinformatics analyses (Dr. S. Simonov)
Компьютерные вычисления - основа биоинформатики
14.10.2013 – Lab (Monday)
SNPs analysis – (P.Dobrynin)
16.10. 2013 (Wed)
Genome Browsers to view genomic data for everyone (Dr. S. Simonov)
Возможности геномных браузеров для анализа генетических данных.
21.10. 2013 (Monday)
Pathogen phylogenomics as to combat infections (Dr.E.Chernyaeva)
Применение молекулярной филогеномики для борьбы с инфекционными заболеваниями
23. 10. 2013 (Wed)
Forensic applications- some examples (Dr. S’Obrien - in English)
30.10. 2013 (Wed)
Statistical methods in genome association analyses (Dr. S. Malov)
Статистические методы поиска генетических закономерностей
06.11. 2013 (Wed)
Statistical package R for genome association analyses (Dr S.Malov)
Использование R для поиска генетических закономерностей
11.11.2013 – (Monday)
Human genetic disease from genetic counseling to personal genomics (Dr. O.Bajenova)
Перспективы биоинформатики в изучении заболеваний человека.
13.11. 2013 (Wed)
Microbiomes (Dr. A. Lapidus)
Микробиом
18.11.2013- Lab (Monday)
Genome Browsers (A. Makunin)
Геномные браузеры
20.11. 2013 (Wed)
Using maps in genome assembly (A. Makunin)
Использование карт для сборки геномов
27.11. 2013 (Wed)
Epigenetics and multifactorial phenotypes (Dr.V.Brukhin)
04.12.2013 (Wed)
Genome structure-Genes make things like transcripts and proteins (Dr.V.Brukhin)
11.12.2013 (Wed)
Comparing the genomes (A.Makunin)
Сравнительная и эволюционная геномика
18.12.2013 (Wed)
What do genes do - Functional genomics from bioinformatics view (Dr.V.Brukhin)
25.12.2013 (Wed)
Complex disease genes discovery in epidemiological cohorts (Dr.A.Svitin)
Поиск генов, влияющих на заболевания, на основе анализа данных когортных исследований
Dates for the following extra lectures and Labs are TBD:
Lectures
Patterns of gene variants in natural population (Dr.K. Koefpli - in English)
Phylogenetics and phylogenomics- methods and applications (Dr.K. Koefpli- in English)
Computer Labs
Phylogenetics analyses software NJ<,MP,ML<, BAYES (Dr.K.Koepfli- in English)
PopGen software (Dr.K.Koepfli- in English)