Алгоритмы в биоинформатике (практика)

Практика основана на алгоритмических задачах, имеющих применение в биоинформатике. Решения задач можно писать на любом популярном языке программирования (С++, Python, Java и др.)

Программа:

Включает программирование решений разнообразных задач на алгоритмы в биоинформатике. Автоматическая проверяющая система находится по адресу http://judge.bioinf.spbau.ru/cgi-bin/new-client?contest_id=3. Логины/пароли получать у преподавателя.

Темы и даты:

• Базовые алгоритмы, motif finding, dynamic programming, sequence alignments, genome rearrangements — до 1 ноября (задачи AA-L)
• Pattern matching, suffix trees/arrays — до 21 ноября (задачи M-T)
• Evolutionary trees — до 20 декабря (задачи U-Z)