Александр Предеус

Александр Предеус закончил Химический факультет МГУ им. Ломоносова в 2003-м году. После этого учился в аспирантуре Michigan State University под руководством William D. Wulff, по результатам чего в 2009-м году получил степень Ph.D. Далее Александр сменил род деятельности, и изучал молекулярную динамику протеинов и комплексов протеинов с ДНК под руководством Michael Feig. C 2012 по 2015-й год изучал биоинформатику высокоэффективного секвенирования (RNA-seq, ChIP-seq) под руководством Максима Артемова в Washington University School of Medicine (St. Louis). С августа 2015-го года Александр возглавляет научную работу в Институте биоинформатики.

Последняя версия CV

Если у вас есть вопросы, пишите на адрес predeus at gmail.com.

Преподаваемые курсы:

Название курса Начало Окончание Преподаватель
Практические навыки биоинформатического анализа последовательностей 13 Apr 2016 13 May 2016 Александр Предеус

Руководитель проектов:

Начало: Sep 2016
Название проекта Начало Окончание Студент Руководитель
NGS в HLA-типировании Sep 2016 Dec 2016 Екатерина Купряшова Александр Предеус
Имплементация определителя широких пиков ChIP-seq на базе алгоритма SICER, и валидация его работы на расширенном наборе экспериментальных данных Sep 2016 Dec 2016 Игорь Бездворных Александр Предеус
Исследование транскриптома человека в норме и при патологиях Sep 2016 Dec 2016 Максим А. Нестеренко Александр Предеус
Поиск молекулярных основ дифференциальной окраски хромосом Sep 2016 Dec 2016 Дарья Зенкова Александр Предеус
Юрий Барбитов
Разработка алгоритма деконволюции экспериментов РНК-сек для определения содержания иммунных клеток в образцах раковых опухолей Sep 2016 Dec 2016 Максим Холматов
Полина Козюлина
Александр Предеус
Разработка и улучшение поисковых стратегий в системе GeneQuery Sep 2016 Dec 2016 Валерия Богданова
Елена Плеханова
Александр Предеус
Начало: Jun 2016
Название проекта Начало Окончание Студент Руководитель
SICER (?) 2 Jun 2016 Sep 2016 Игорь Бездворных Александр Предеус
Начало: Feb 2016
Название проекта Начало Окончание Студент Руководитель
Search for functional NF-kB binding sites via meta-analysis of NGS experiments in human cell lines Feb 2016 May 2016 Николай Панюшев Александр Предеус
Мета-анализ экспрессии генов в жировой ткани человека Feb 2016 May 2016 Дмитрий Смирнов Александр Предеус
Начало: Sep 2015
Название проекта Начало Окончание Студент Руководитель
GeneQuery - веб-сервер для генерации биологических гипотез на основании транскрипции Sep 2015 Dec 2015 Юрий Барбитов Александр Предеус
Нахождение оптимального клеточного базиса для сборки транскриптома Sep 2015 Dec 2015 Эрик Живкопляс Александр Предеус
Разработка R-пакета для деконволюции типов клеток по данным экспрессии Sep 2015 Dec 2015 Анастасия Коростелева Александр Предеус
Разработка R-пакета для деконволюции типов клеток по данным экспрессии Sep 2015 Dec 2015 Марина Слащева Александр Предеус
Начало: Sep 2015
Название проекта Начало Окончание Студент Руководитель
ClusDec: де-ново деконволюция клеточных типов из данных транскрипции без использования клеточных подписей. Sep 2015 Sep 2015 Александр Предеус
Начало: Jun 2015
Название проекта Начало Окончание Студент Руководитель
BroadPeaks - ре-имплементация алгоритма SICER для определения пиков в соответствующих экспериментах ChIP-Seq. Jun 2015 Aug 2015 Егор Приказюк Александр Предеус